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王俊新发Nature综述:微生物组与宏基因组关联分析

本文摘要:我们体内生活着不计其数的微生物,它们构成的生态系统就是微生物组。近年来人们找到这些微生物对人体身体健康具有最重要的影响,微生物组研究因此受到了很大的推崇,甚至被称作是人体的第二基因组。 微生物组参予了许多最重要的机体功能,比如消化食物、制备营养物质和抵挡疾病。 许多人类疾病都与微生物组流失有关,但说明了其中的因果关系并不更容易。因为微生物组是由数百种细菌构成的简单生态系统,同种细菌的有所不同菌株也不存在显著的遗传差异。

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我们体内生活着不计其数的微生物,它们构成的生态系统就是微生物组。近年来人们找到这些微生物对人体身体健康具有最重要的影响,微生物组研究因此受到了很大的推崇,甚至被称作是人体的第二基因组。  微生物组参予了许多最重要的机体功能,比如消化食物、制备营养物质和抵挡疾病。

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许多人类疾病都与微生物组流失有关,但说明了其中的因果关系并不更容易。因为微生物组是由数百种细菌构成的简单生态系统,同种细菌的有所不同菌株也不存在显著的遗传差异。

  宏基因组关联分析(MWAS)是挖出微生物组宝藏的有力工具,可以高分辨率研究微生物组与简单疾病的关联,比如二型糖尿病、肥胖症、肝硬化、大肠癌和类风湿性关节炎。MWAS不仅能检验金属量发生变化的细菌种类,还需要辨别细菌功能的强化或弱化。  iCarbonX公司CEO王俊和华大基因BGI的HuijueJia最近在NatureReviewsMicrobiology杂志上发表文章,讲解了MWAS研究最近的一些找到,探究了这些找到对疾病防治、临床和化疗的潜在影响。

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文章认为,我们必须在人类微生物组中更佳地叙述细菌生物学特性,这样才能解读MWAS检验的细菌菌株与疾病有何关系。  去年五月,华大基因和瑞典哥德堡大学的研究人员对98名一岁以内的瑞典婴儿展开了肠道菌群分析。婴儿的微生物组必须在茁壮过程中渐渐成熟期。

我们仍然以为引进液体食物是转变婴儿肠道菌群的关键因素,但这项研究指出推展微生物构成煮的只不过是断奶。研究人员找到,即使引进了液体食物,非母乳婴儿的微生物组仍旧比母乳婴儿更加相似成人。


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